Родился в 1889 году в деревушке Кило, находящейся в подчинении губернаторства эль-Минья. Он был седьмым из тринадцати детей в семье. Будучи неполных четырёх лет от роду, лишился зрения. В своей родной деревне Таха Хуссейн обучался арабскому языку, математике, изучал Коран.
В 1902 году Таха поехал в Каир и поступил в аль-Азхар. В дальнейшем об учёбе в аль-Азхаре он напишет в своей автобиографической повести «Дни».
В 1908 году он поступил в только что открывшийся Каирский университет. Закончил его в 1914 году, получив степень доктора философии за работу, посвященную арабскому поэту и философу Абуль Аля аль-Маари.
Продолжил свое обучение Таха Хусейн во Франции. Его докторская диссертация была посвящена социальной философии Ибн Хальдуна и носила название «Etude analitique et critique de la philosophie sociale d’Ibn Khaldoun» (1917).
В 1919, вернувшись после обучения во Франции (где он повстречал Сюзанну Брессо, ставшую его женой, матерью его детей и верным другом на всю жизнь), он стал профессором истории в Каирском университете.
Занимал должности ректора Александрийского университета (1943—1946), министра просвещения Египта (1950—1952). С 1965 года — президент академии арабского языка в Каире. В арабском мире за ним закрепилось прозвище «старейшина арабской литературы» (араб. ???? ????? ????????)
В 1973 году в последние дни жизни Тахи Хусейна ему была присуждена премия ООН в области прав человека.