Теодоро Обианг Нгема Мбасого родился 5 июня 1942 года в Акоакане. Выходец из влиятельного клана Эсангуи. Окончил школу в Бате.
8 января 1976 года он отдал приказ штурмовать консульство Нигерии, в результате чего 11 человек погибли, а в декабре того же года лично арестовал более сотни гражданских чиновников, которые протестовали против экономической политики его дяди.
3 августа 1979 года подполковник Теодоро Обианг возглавил военный переворот, осуществлённый 400 наёмниками из Марокко, свергнув пожизненного президента страны и своего родного дядю — Франсиско Масиаса Нгему. Свергнутый президент предстал перед судом, который 29 сентября приговорил его к смертной казни, после чего он в тот же день был расстрелян. 12 октября Обианг стал новым президентом страны.
В 1981 году он получил воинское звание полковника. 15 августа следующего в стране прошёл референдум, по итогам которого была принята новая конституция.
В 1991 году на шельфе в территориальных водах Экваториальной Гвинеи был обнаружены обширные запасы нефти. 17 ноября того же года на референдуме была принята новая конституция, которая установила многопартийную систему.
25 февраля 1996 года в стране прошли президентские выборы, победу на которых одержал единственный кандидат Теодоро Обианг Нгема, набравший 97,85 % голосов. Оппозиция тогда бойкотировала выборы. На следующих президентских выборах, прошедших 15 декабря 2002 года, он был вновь переизбран, набрав 97,1 % голосов.
В 2003 году государственное радио объявило, что Теодоро Обианг Нгема «подобен Богу на небесах» и находится «в постоянном контакте со Всемогущим», причём президент обладает «всею властью над людьми и вещами». В 2007 году он предложил внести изменение в конституцию, добавив к испанскому и французскому третий официальный язык — португальский.
6 марта 2004 года в аэропорту Хараре (Зимбабве) властями республики был арестован британец Саймон Манн, который встречал Boeing-727 с 64 пассажирами, летевший из ЮАР. Вскоре выяснилось, что пассажиры этого самолёта являются наёмниками, которые летели в Экваториальную Гвинею для участия в свержении Теодоро Обианга Нгемы. Через несколько дней в самой Экваториальной Гвинее было арестовано 15 иностранных граждан, обвиняемых в попытке свержения президента страны, 11 из которых суд приговорил к различным срокам тюремного заключения, 1 скончался во время следствия (по некоторым данным, от пыток), а остальные были оправданы. В заговоре оказался замешан сын Маргарет Тэтчер — Марк, который в 2005 году признался в оказании содействия при приобретении вертолёта, который мог использоваться при осуществлении заговора. Однако он отметил, что ничего не знал о планах заговорщиков. Арестованный же в Зимбабве британец также заявил на суде, что к перевороту имели отношение Испания, США и ЮАР, а главным организатором являлся ливанский нефтяной магнат Элила Калила.
17 января 2009 года группа вооружённых людей, переправившись на лодках на остров Биоко, атаковали президенский дворец, но в ходе завязавшейся перестрелки один их нападавших был убит. Сперва власти обвинили в атаке членов Движения за освобождение дельты Нигера, затем бывшего лидера оппозиционной партии «Народный союз» Фаустино Ондо Эбангу. 21 августа 2010 года суд, признав виновными в организации нападения, а также в терроризме и государственной измене, приговорил к смертной казни капитана сухопутных войск Хосе Абесо Нсуе Нчаму, его заместителя Мануэля Ндонг Ансеме, экс-главу таможни страны Хакинто Мича Обиангу и сотрудника службы безопасности президента Алипио Ндонг Асуму. Вскоре после вынесения приговора подсудимые были казнены. Теодоро Обианг Нгема по этому поводу заявил: «Эти люди несли угрозу мне, моей семье и моему правительству. Поэтому судопроизводство в отношении них было быстрым».
В настоящее время Обианг страдает от рака, и рассматривается вопрос о его наследнике. Сын президента, Теодор Обианг младший (более известный под именем Теодорин) подозревается властями США в коррупции: он владеет роскошной виллой в Малибу (штат Калифорния), которую он приобрёл за 35 миллионов долларов. Теодорин, через центральный банк Франции, перевёл в 2005—2006 годах в банки США крупную сумму денег, которые он незаконно присвоил во время работы министром сельского хозяйства и лесоперерабатывающей промышленности в правительстве своего отца.
Теодоро Обианг Нгему Мбасого часто назначал на высшие государственные посты своих родственников.
Ключевые посты в государстве получили также родственники жены президента.