Из сочинений и работ его упомянем: «Die Blaus aure», «Die Blutkrystalle», «Die Seele des Kindes», «Elemente der allgemeinen Physiologie», «Farben und Temperatursinn», «Die Ursache des Schlafes», «Akustische Untersuchungen», «Elemente der reinen Empfindungslehre», «Reise nach Island»; перевод «Гипнотизма» Брэда и «Valacritis Genese des Thieres». Им же написана физиология зародыша («Physiologie des Embryo») и опубликована переписка его со знаменитым Фехнером. Покинув Йену, Прейер состоял еще несколько лет в качестве приват-доцента физиологии при Берлинском университете и умер в 1897 году.