Том Филипс был сыном полковника Королевской артиллерии Томаса Вогана Винна Филипса. Его мать, Луиза Мария Аделина де Хорси Филипс, была дочерью адмирала Элджернона Фредерика Роуса де Хорси.
Филипс имел рост 5 футов 4 дюйма, то есть был ниже даже адмирала Нельсона. На момент своей гибели в 53 года он был одним из самых молодых адмиралов Королевского флота и одним из самых молодых главнокомандующих.
Том Филипс вступил в Королевский военно-морской флот Великобритании в 1903 году, став морским кадетом. В 1904 году он стал мичманом и проходил практику на додредноуте «Британия». 9 апреля 1908 года он был произведён в сублейтенанты, а 20 июля 1909 года — в лейтенанты.
Во время Первой мировой войны Том Филипс служил на эсминцах на Средиземноморье и Дальнем Востоке. 15 июля 1916 года он был произведён в лейтенант-коммандеры.
С июня 1919 года по май 1920 Филипс учился в Королевском военно-морском колледже. С 1920 по 1922 годы он был военным советником в составе Комиссии постоянных советников при Комитете по военным, воздушным и морским делам Лиги Наций.
В июне 1921 года Филипс был произведён в коммандеры, а в июне 1927 года — в капитаны. 4 сентября 1928 года он получил под командование эсминец «Кампбелл», и оставался в этой должности до августа 1929 года.
С 24 апреля 1930 года по сентябрь 1932 года Том Филипс был заместителем директора Отдела планирования Адмиралтейства. После этого он в течение трёх лет служил на Дальнем Востоке, будучи флаг-капитаном на крейсере. В 1935 году он вернулся в Адмиралтейство и возглавил Отдел планирования.
В 1938 году Филипс был произведён в коммодоры и получил под командование флотилию эсминцев Хоум-флита.
10 января 1939 года Том Филипс стал контр-адмиралом, в это время он был советником по военно-морским вопросам короля Георга VI. С 1 июня 1939 по 21 октября 1941 года Филипс был заместителем начальника и вице-начальником Генерального штаба ВМФ. В феврале 1940 года Уинстон Черчилль назначил Филипса вице-адмиралом.
В июле 1941 года Том Филипс помог поставить под сомнение итоги расследования гибели линейного крейсера «Худ», что привело к повторному изучению обстоятельств дела.
В конце 1941 года Том Филипс был назначен главнокомандующим Восточным флотом. 25 октября 1941 года он был произведён в адмиралы и отправился в Сингапур вместе с Соединением G. После прибытия в Сингапур 2 декабря 1941 года силы под командованием Филипса были реорганизованы в Соединение Z. 7 декабря Япония напала на США и Великобританию. Получив информацию о том, что к берегам Малайского полуострова движется японский конвой с десантом, Филипс вышел на его перехват с линкором «Принц Уэльский» и линейным крейсером «Рипалс». 10 декабря 1941 года оба эти корабля были потоплены японской авиацией. Адмирал Филипс погиб вместе с кораблями.