Тони Скотт родился в небольшом городке Норт-Шилдс в Северо-Восточной Англии. Его мать — актриса Элизабет Скотт, Тони рос с двумя старшими братьями: Фрэнком и Ридли. Будущий режиссёр начал кинокарьеру как актёр: в возрасте шестнадцати лет он снялся в дебютной короткометражке своего двадцатитрёхлетнего брата Ридли. Он закончил Королевский колледж искусств, в котором ранее учился его брат, и намеревался стать художником, но скоро присоединился к брату, который занимался производством рекламы. В течение двух десятилетий он снял около тысячи рекламных роликов для британского телевидения. После того успеха, который на рубеже 1970-х-1980-х сопровождал в США фильмы английских режиссёров Алана Паркера, Эдриана Лайна, Хью Хадсона и Ридли Скотта, Тони Скотт тоже был приглашён для работы в Голливуд.
Сначала он хотел экранизировать роман Энн Райс «Интервью с вампиром», но ему не удалось договориться с компанией Metro-Goldwyn-Mayer о запуске проекта. У MGM имелся свой сценарий о вампирах, который и воплотил в кино Тони Скотт. Эстетский фильм «Голод» с участием Дэвида Боуи и Катрин Денёв, вышел в 1982 году. Он не имел успеха, поэтому Скотт вернулся к рекламе и музыкальному видео. В 1985 году продюсеры Дон Симпсон и Джерри Брукхаймер пригласили Скотта для постановки высокобюджетного фильма «Лучший стрелок». Симпсон и Брукхаймер были в числе немногих поклонников «Голода», так же им понравилась реклама, которую Скотт снял для шведского автоконцерна Saab в начале 1980-х.
После успеха «Лучшего стрелка», где в роли молодого пилота снялся Том Круз, Скотт стал специализироваться на боевиках. Вместе с Симпсоном и Брукхаймером он снял «Полицейского из Беверли-Хиллз-2», сиквел популярного комедийного боевика с Эдди Мёрфи в главной роли. Его следующий фильм «Месть», где Скотт заменил уволенного продюсерами Джона Хьюстона, провалился в прокате.
В 1990 году Скотт продолжил сотрудничество с Симпсоном, Брукхаймером и Крузом в фильме об автогонщиках «Дни грома». В следующем году вышел боевик с Брюсом Уиллисом «Последний бойскаут». В 1992 году режиссёр познакомился с Квентином Тарантино, который дал прочитать ему два своих сценария: «Бешеные псы» и «Настоящая любовь». Скотт сказал, что снимет фильмы по обоим сценариям, но Тарантино ответил, что «Бешеных псов» хотел бы снимать сам. «Настоящая любовь» с участием Кристиана Слэйтера, Патриции Аркетт, Кристофера Уокена, Гэри Олдмена и других актёров заставила воспринимать Скотта как серьёзного режиссёра.
Следующий фильм Скотта «Багровый прилив», политический триллер о противостоянии России и США, где он снова вернулся к сотрудничеству с Симпсоном и Брукхаймером, стал хитом 1995 года. Триллер «Фанат» (1996), несмотря на участие Роберта Де Ниро и Уэсли Снайпса, стал очередной неудачей режиссёра: он не понравился ни зрителям, ни критикам. В 1998 году, когда вышел триллер «Враг государства», Скотта снова ждал успех.
Новое десятилетие Скотт начал фильмом «Шпионские игры», который посвятил памяти своей матери, умершей в 2001 году. Затем снимал фильмы «Гнев», «Домино», «Дежа вю», рекламные ролики для «Мальборо» и армии США. Вместе с братом Ридли стал основателем продюсерской компании Scott Free Productions. Среди их работ: сериал «Числа», в котором Тони Скотт снял также первую серию четвёртого сезона, и сериал «Штамм „Андромеда“» — новая экранизация одноимённого романа Майкла Крайтона.
Скотт был трижды женат, от третьего брака с актрисой Донной Уилсон Скотт имеет двух детей: Фрэнка и Макса. Его племянники (дети Ридли Скотта) — режиссёры Джейк Скотт и Джордан Скотт.