Сын Омара Торрихоса, главнокомандующего армией Панамы и фактического лидера страны с 1968 по 1981. Заместитель министра внутренних дел и юстиции в 1994—1999 в правительстве президента Эрнесто Переса Бальядареса. В 1999 на президентских выборах проиграл Мирейе Москосо, правительство которой к концу пятилетнего срока было чрезвычайно непопулярно. В 2004 как кандидат от Демократической революционной партии одержал победу на президентских выборах, победив экс-президента, кандидата Социалистической партии Гильермо Эндару. Проводит налоговые реформы и реформы социального обеспечения. Разработан проект расширения Панамского канала. Торрихос поддерживает идею предоставления Пуэрто-Рико независимости от США.
3 мая 2009 года на очередных президентских выборах победу одержал представитель оппозиционной партии, 57-летний владелец сети супермаркетов Рикардо Мартинелли. Он представляет консервативную партию «Демократическая перемена» (Cambio Democr?tico). Представительница правящей Революционно-демократической партии (Partido Revolucionario Democr?tico) Бальбина Эррера потерпела поражение. Мартин Торрихос не мог участвовать в выборах ввиду того, что конституция ограничивает период президентства одним сроком.