В 1968 году закончил Военный факультет при Государственном дважды орденоносном институте физической культуры имени П. Ф. Лесгафта.
Неоднократный чемпион СССР: 1959 в парной гонке по треку; 1962 в командной гонке по шоссе; 1956 в многодневной гонке; 1958 в групповой и командной гонке.
Семь раз стартовал в велогонке Мира. Победитель этой гонки в командном зачете — 1958, 1969, 1961, 1962.
На первых для себя Олимпийских играх 1956 года в Мельбурне Виктор Капитонов выступил неудачно, в шоссейной гонке он был тридцать вторым, причиной провала стало падение в ходе гонки, в командной гонке советские велосипедисты довольствовались шестым местом. На следующих Олимпийских играх в Риме, в составе четверки в рамках командной гонки Капитонов становится бронзовым призером игр. В шоссейной групповой гонке Виктор Арсеньевич становится чемпионом Олимпийских игр, обойдя на финишной черте, лишь на пол колеса итальянца Ливио Траппе. В следующих Олимпийских играх Капитонов уже участия не принимал, полностью сконцентрировавшись на тренерской работе.
С 1965 по 1985 год — главный тренер сборной команды велосипедистов-шоссейников. В 1975 и 1976 назван лучшим тренером СССР и награжден золотой медалью за подготовку сборной СССР к чемпионату мира 1970, где она впервые стала чемпионом мира в командной гонке. Под его руководством команда СССР побеждала на велогонке Мира — 1970—1972, 1975 и 1977.
В 1983 году защитил диссертацию, получив степень кандидата педагогических наук.
Ушел из жизни в 2005 году в возрасте 71 года.
Почетный гражданин Твери, кавалер ордена Ленина, «Знак Почета», Дружбы народов, Октябрьской революции.