Учился во 2-й Санкт-Петербургской гимназии. С 1883 г. состоял на службе в Императорской Публичной библиотеке помощником библиотекаря Русского отделения, с работой в котором связана вся дальнейшая деятельность Саитова. В 1909 г. он возглавил это отделение, а с 1928 года, в котором Саитов вышел на пенсию, Русское отделение по инициативе Н. Я. Марра получило его имя.
Наиболее важным из трудов Саитова является совместная с Л. Н. Майковым редакция «Сочинений К. Н. Батюшкова» (СПб., 1887). Под скромным названием «примечаний» в этом издании помещены принадлежащие перу Саитова обстоятельные биографии почти всех главнейших деятелей русской литературы начала XIX в.
Некоторые из этих биографий представляют собой обширные, первые в литературоведении исследования о русских писателях; таковы, напр., биографии А. И. Тургенева, кн. П. И. Шаликова, Д. В. Дашкова, М. Н. Муравьёва, В. А. Озерова, В. В. Капниста, В. Л. Пушкина, А. Н. Грузинцева. По общему отзыву критики конца XIX в., эти «примечания» Саитова составляют украшение издания, которое благодаря им является настольной книгой для историка русской литературы.
Такой же тщательностью отличаются и примечания Саитова к изданию гр. С. Д. Шереметева: «Остафьевский архив», выходящему под ред. С. (т. I: «Переписка кн. Вяземского с А. И. Тургеневым», СПб., 1899).
Под руководством Саитова начали свои историко-литературные труды многие молодые учёные, стремящиеся к той же точности и полноте исследования, какой отличаются работы Саитова.
Академия наук привлекла Владимира Ивановича Саитова в сотрудники предпринятого ей издания сочинений Пушкина. Саитову принадлежала одна из самых полных частных библиотек, посвященных истории русской литературы.
Саитов имел репутацию добросовестного историка литературы, библиографа, фанатика своего дела. Он говорил К. И. Чуковскому, увидев в одной из брошюр штамп, поставленный прямо на портрете Л. Д. Троцкого: «Я сам не люблю Троцкого, с удовольствием повесил бы его. Но зачем должна страдать иконография?»