Брат Йохана Афцелиуса и Пера Афцелиуса.
В 1777 преподавал восточные языки в Упсальском университете.
В 1792 отправился с естественно-научной целью на западное побережье Африки, в частности, в английскую колонию Сьерра-Леоне, где вследствие нападения и грабежа, произведённого французами, он потерял все свои коллекции.
В 1797—1798 был секретарём шведского посольства в Лондоне.
После возвращения, в 1799 стал академическим преподавателем ботаники в Упсальском университете и получил в 1812 звание профессора materia medica.
В 1802 был избран президентом Линнеевского института («Зоофитолитического общества»).
Как ботанический писатель, Афцелиус известен многими своими произведениями, равно изданной им в 1823 автобиографией Линнея.
Его именем названы роды растений:
- Afzelia Sm.
- Afzeliella Gilg
Этнографические и ботанические коллекции Афцелиуса были куплены Упсальским университетом.
Растения, описанные Афцелиусом
Роды
- Anthocleista Afzel. ex R.Br.
- Cyclocarpa Afzel. ex Baker
- Erythrophleum Afzel. ex R.Br.
- Rivinoides Afzel. ex Prain
- Sarcocephalus Afzel. ex R.Br.
- Virecta Afzel. ex Sm.
Виды
- Amomum latifolium Afzel.
- Amomum palustre Afzel.
- Bilabrella ichneumonea (Afzel. ex Sw.) Szlach. & Kras Lap.
- Bolbitis acrostichoides (Afzel.) Ching in C.Chr.
- Commelina rhizocarpa Afzel. ex C.B.Clarke
- Ctenitis protensa ( Afzel.) Copel.
- Dryopteris protensa ( Afzel.) C.Chr.
- Echites lobatus Afzel. ex A.DC.
- Echites loratus Afzel. ex Steud.
- Echites parviflorus Afzel. ex Steud.
- Eriocaulon pumilum Afzel. ex K?rn.
- Gardenia assimilis Afzel. ex Hiern
- Gardenia crinita Afzel.
- Hippocratea velutina Afzel. ex Spreng.
- Jasminum noctiflorum Afzel.
- Justicia tunicata Afzel.
- Limodorum bidens Afzel. ex Sw.
- Mimosa incurvata Afzel.
- Orchis ichneumonea Afzel. ex Sw.
- Orchis membranacea Afzel. ex. Sw.
- Panicum praealtum Afzel. ex Sw.
- Panicum strictissimum Afzel. ex Sw.
- Pavetta mollis Afzel. ex Hiern
- Pavetta parviflora Afzel.
- Periploca nigrescens Afzel.
- Psydrax parviflora ( Afzel.) Bridson
- Rauvolfia vomitoria Afzel.
- Spermacoce compressa Afzel. ex Hiern
- Usteria volubilis Afzel.
- Uvaria piperita Afzel.