Родом из крестьянской семьи. Получил военное образование, окончил военную академию в Мюнхене в 1912 г. В годы 1-й мировой войны командовал батальоном, награждён несколькими Железными крестами, в конце войны служил при Генеральном штабе.
После войны командовал батальоном во фрайкоре Ф. фон Эппа. В 1923 г. выступил в защиту Гитлера, в связи с чем был вынужден покинуть рейхсвер. В том же году участвовал в нацистском путче и провёл 6 месяцев в заключении.
С 1924 входит в высшее руководство СА, с 1925 — квартирмейстер НСДАП. Эрнст Рём присвоил ему звание обергруппенфюрера СА и начальником автомобильной службы СА. В 1930 г. был основан Национал-социалистический автомобильный корпус, переименованный в 1931 г. в НСКК, как подразделение СА. После смерти Рёма Гитлер выделил НСКК в качестве самостоятельной организации, хотя фактически с тех пор она была под контролем СС.
Во время войны отвечал за транспорт в рейхе, в том числе на оккупированных территориях.
Посмертно получил высшую награду рейха — Германский орден. Его преемником был назначен Эрвин Краус. До настоящего времени Хюнлайн является почётным гражданином городов Байройт и Арвайлер.