Отец Вернера Радбот скончался в 1045 году. Его сыновья Вернер I, Оттон I и Альбрехт I поделили между собой графство Габсбург и некоторые другие владения отца. Все трое носили титул графа Габсбург. Вернер I был младшим сыном, однако о его братьях сохранилось значительно меньше упоминаний. Около 1055 года или раннее Оттон был убит, а Альбрехт скончался ещё раньше этого. Вернер стал обладателем всего графства.