Александр Пономаренко 27 октября 1964 года в Белогорске (Украина).
В 1988 году окончил физический факультет Симферопольского государственного университета.
В 1983—1985 годах проходил воинскую службу в частях ВДВ.
В 1987—1992 года, вместе с партнером Александром Скоробогатько, занимался частным бизнесом на Украине организовав в Крыму производство парфюмерной продукции.
В 1992—1994 годах, вместе с партнером, переехал в Москву.
В 1992—1998 годах работал главным научным сотрудником в Международном институте корпорации (Москва).
В 1994 стал соучредителем Русского генерального банка.
В 1997 году окончил Российскую государственную академию управления им. Серго Орджоникидзе[уточнить]
Получил степень кандидата экономических наук написав диссертацию на тему: «Государственное регулирование среднего и малого бизнеса на примере Москвы».
В 1998 году становится проректором АНО «Международный Институт Корпораций».
В 1998 году партнеры начали скупать акции Новороссийского морского торгового порта (НМТП) и стивидорных компаний.
В 2001 году защитил докторскую диссертацию на тему: «Государственное регулирование интегрированных корпоративных систем».
В 2003 году становится председателем совета директоров ООО «Новороссийский зерновой терминал».
В 2004 году стал председателем совета директоров ООО «Новороссийский навалочный комплекс».
В 2004 году становится председателем совета директоров ОАО «Новорослесэкспорт».
С 2004 года занимает пост председателя Совета директоров ОАО «Новороссийский морской торговый порт».
В 2004 году занял пост председателя совета директоров ООО «Балтийская стивидорная компания».
С 2004 года — президент ОАО «Инвестиционная компания „ТПС“».
В 2006 году партнеры продали банковский бизнес венгерскому OTP Bank.
В 2007 году партнеры стали собственниками 70 % акций НМТП и провели IPO компании на Лондонской фондовой бирже, ММВБ и РТС.
Весной 2008 года совладельцы Новороссийского морского торгового порта провели стратегическую сделку — продали 10 % акций компании структурам Аркадия Ротенберга, занимавшегося в молодости дзюдо в одной группе с Владимиром Путиным.
Женат, трое детей.
Входит в рейтинг журнала Forbes с 2008 года, занимая места с 43 (2009) по 68 (2008) с состоянием с 800 млн долларов США (2009) по 1 500 млн долларов США (2008). В 2010 году занимал 59 место с состоянием 1 100 млн долларов США.
Любит охоту. Коллекционирует антикварные книги про охоту. Также коллекционирует живопись передвижников, живопись «Серебряного века», полотна Айвазовского, Боголюбова.