В 1971 году поступил на экономический факультет МГУ им. М. В. Ломоносова, а по его окончании — в аспирантуру того же факультета. В 1979 году защитил диссертацию на соискание ученой степени кандидата экономических наук, в 1989 году — доктора экономических наук. C 1991 года по настоящее время — профессор кафедры политической экономии экономического факультета МГУ.
С середины 80-х гг. прошлого века принимает активное участие в общественно-политической жизни — организация дискуссионного кружка в МГУ, затем клуба независимых марксистских исследований. Принимал участие в создании ФСОК (Федерация социалистических общественных клубов). В начале 1994 года А. В. Бузгалин стал инициатором создания новой общественной структуры, — движения «Ученые за демократию и социализм» — сконцентрировав усилия на организации в первую очередь научно-теоретической и пропагандистской работы. В 1990—1991 годах был членом ЦК КПСС. В 1991 г. А. В. Бузгалин принял участие в основании независимого левого журнала «Альтернативы».
Успешная активная деятельность движения «Ученые за демократию и социализм» и развитие сети активных читателей и распространителей журнала «Альтернативы» позволили к 2000 году провести учредительные мероприятия и зарегистрировать Всероссийское общественное движение «Альтернативы». В 2005 и 2006 гг. выступал одним из инициаторов и организаторов первого и второго Российских социальных форумов.
Автор книг (совместно с А.И. Колгановым):