С 1930 г. работал во Франции; c 1931 г. — в Коллеж де Франс, где в 1933—1939 и в 1944 гг. заведовал кафедрой химии. Действительный член АН СССР (с 1929).
В 1936 г. отказался вернуться в СССР. 29 декабря 1936 г. Общее собрание АН СССР лишило А. Е. Чичибабина и В. Н. Ипатьева звания действительных членов как потерявших связь с Академией; 5 января 1937 г. он был лишён советского гражданства. 22 марта 1990 г. Общее собрание АН СССР приняло постановление о восстановлении (посмертно) в членах Академии многих учёных, необоснованно исключенных из её состава, в том числе и А. Е. Чичибабина.
Его книга «Основные начала органической химии» является одной из лучших и выдержала неоднократные переиздания.