Ален Конн родился 1 апреля 1947 года в городе Драгиньян на юге Франции. В 1966—1970 годах учился в Высшей Нормальной школе Парижа. В 1973 году защитил диссертацию одновременно работая практикантом в CNRS. В 1976—1980 годах работал профессором в университете Пьера и Мари Кюри, в 1981—1984 годах был директором исследований в CNRS. В настоящее время преподаёт в Высшем научном институте и в университете Вандербильта, также заведует кафедрой анализа и геометрии в Коллеж де Франс.
Ален Конн является одним из признанных специалистов в области изучения операторных алгебр. Его ранние работы касались алгебр фон Неймана. Также Конн известен своими работами в области теории чисел, дифференциальной геометрии и физики элементарных частиц. 3 апреля 2010 года Ален Конн опубликовал теорию, объясняющую все взаимодействия через некоммутативную геометрию (), предсказания которой совпадают с выводами из Стандартной модели.