Родился в 1836 году в Париже в состоятельной семье, в 1857—1860 годах путешествовал по Америке, Азии и Африке вместе с братом Эрнестом и будущим известным астрономом П-Ж. Жансеном, в 1865—1870 годах исследовал Мадагаскар. На Мадагаскаре Грандидье открыл несколько хребтов, описал представителей флоры и фауны острова.
По окончании исследований, совместно с сыном Гийомом написан многотомный труд Histoire physique, naturelle et politique de Madagascar, в котором описал не только географию, флору и фауну острова, но также традиции и общественное устройство малагасийцев.
В честь Грандидье названы род растений Грандидьера (Grandidiera Jaub.) семейства Флакуртиевые и один из видов адансоний. Также в его честь назван один из видов орхидей, растущих на Мадагаскаре, — Angraecum didieri.