Дочь короля Баварии Максимилиана I и его второй жены Каролины Баденской. У Амалии Августы была сестра-близняшка Елизавета Людовика, впоследствии королева Пруссии. Другими её родными сестрами были Людовика и близняшки София и Мария Анна.
21 ноября 1822 года в Дрездене Амалия Августа вышла замуж за принца Саксонии Иоганна (1801—1873). Через десять лет её младшая сестра Мария Анна стала ей снохой, выйдя замуж за брата Иоганна, короля Фридриха Августа II. Иоганн стал королем в 1854 году, и Амалия Августа получила титул королевы. У супругов было девять детей: