Большую часть футбольной карьеры провёл за клуб «Спартак» Москва за который выступал на протяжении 11 сезонов, выиграв с клубом 3 кубка СССР. Помимо «Спартака» играл за любительские клубы «Локомотив-Клубная», «Спартак-Клубная» и «Химик» Электросталь.
После окончания карьеры руководитель любительскими командами «Химик» Электросталь, Труд Горенки, в 1960-е годы работал тренером секции футбола города Москвы.
Одновременно с этим работал хоккейным тренером. В 1955-58 — старший тренер ХК Спартак (Москва).
Награждён медалью ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени (1995).
Скончался Анатолий Сеглин 10 марта 2009 года в Москве после долгой и продолжительной болезни, похоронен 13 марта на Ваганьковском кладбище.