В конце 1990-х место его в воротах «Ювентуса» казалось незыблемым. Победитель Лиги чемпионов, трёхкратный чемпион Италии. Но появились конкуренты, и Перуцци сменил клуб на Лацио а в сборной прочно сел на скамейку запасных. Сперва стал дублером Тольдо, а затем Буффона. В 2006 году стал чемпионом мира, будучи вратарем № 2 «скуадра адзурры». Завершил карьеру в 2007 году.