Дебютировал в составе сборной Армении 16 июля 1994 года в товарищеской игре против сборной Мальты. Матч проходил в Ереване на стадионе «Раздан» и закончился со счётом 1:0. Эта была третья игра сборной Армении в её истории. Игроков на поле в капитанской повязке выводил Хачатрян. В следующей игре против бельгийской сборной, также принимал участие, однако в последующих 5 матчах отсутствовал. Вновь вышел в составе сборной год спустя, 16 августа 1995 года против сборной Дании. В выездной игре, проходившей в Скопье против сборной Македонии, Хачатрян вышел на поле на 84-ой минуте матча. Эта была его последняя игра в национальной команде.