Детство провёл в Джунгарии. В 1654 году вместе с дедом возвратился в Поволжье.
Пришёл к власти в 1672 году, объединил всех волжских калмыков и значительно расширил свои владения. Аюка вёл в отношении России двуличную политику: неоднократно присягая на подданство, торгуя и тесно сотрудничая с одними русскими (например, известны его контакты с комендантом Саратова Д. Е. Бахметьевым), он в то же время при всяком удобном случае грабил других.
Центральные же власти России, стремясь укрепить своё влияние в Нижнем Поволжье, поддерживали Аюку и использовали его войска при подавлении Астраханского (1705—1706) и Булавинского (1707—1709) восстаний, а также в Северной войне (1700—1721).
С момента окончательного оформления калмыцкого ханства на Волге (1697) резко возрастает роль политического центра созданного автономного образования. Оно воздвигается на левом берегу Волги, напротив Саратова, где сегодня располагается город Энгельс. Это было наиболее выгодное стратегическое расположение, учитывающее многочисленные политические нюансы. В результате именно здесь закладывается ставка хана Аюки.