В 1852 году прибыл в Китай, чтобы там заниматься миссионерской деятельностью в провинции Гуанси. После пребывания в Гуанчжоу, он весной 1854 года отправился в город Гуйян. В декабре он вместе с китайским проводником достиг поселения Яошан, где обнаружил 300 католиков, которым он сразу же отслужил святую мессу, за что был схвачен местными властями и арестован. Спустя десять дней он был освобождён из тюрьмы и возвратился в провинцию Гуанси в декабре 1854 года. В начале 1855 года он был вынужден покинуть столицу провинции Гуанси город Гуанчжоу из-за многочисленных угроз со стороны китайских властей. 22 февраля 1856 года он был снова арестован вместе с Лаврентием Бай Сяомань и приговорён к казни за обращение в католицизм родственника китайского мандарина. Был подвергнут пыткам и помещён в железную клетку, которая была подвешена возле ворот тюрьмы, где он скончался до казни.
Смерть Августина Шапделена стала поводом для французского армейского вторжения, что привело ко Второй Опиумной войне (1856—1860 гг.). После этой войны был подписан договор между Францией и Китаем, в котором миссионерам разрешалось свободное распространение католической веры среди китайцев.
Августин Шапделен был причислен к лику блаженных в 1900 году, 1.10.2000 года он был причислен к лику святых римским папой Иоанном Павлом II вместе с группой 120 китайских мучеников. Его канонизация вызвала негативную реакцию властей КНР. Китайское информационное агентство Синьхуа выпустило пресс-релиз, в котором отрицательно описывалась деятельность Августина Шапделена.