Бакари Санья сыграл за «Осер» 87 матчей в чемпионате Франции и был включен в состав, который выиграл Кубок Франции в 2005 году. Также он играл в Кубке УЕФА в каждом из трех сезонов, когда он был футболистом основного состава.. Бакари сыграл 17 матчей в этом турнире. Также он был включен в символическую сборную чемпионата Франции как правый защитник.
12 июля 2007 года Бакари Санья перешел из «Осера» в лондонский «Арсенал». Ему была предоставлена футболка под номером 3, которую до него носил Эшли Коул, который перешел в лондонский «Челси». 19 июля он дебютировал за новый клуб в товарищеском матче против турецкого футбольного клуба «Генчлербирлиги», которую «Арсенал» уверенно выиграл 3:0. В Премьер-лиге Санья заиграл с 1-го тура в матче против «Фулхэма» («Арсенал» победил 2:1). Санья в большинстве случаев играет правого защитника, хотя он также может сыграть и в центре, и на левом фланге и даже в полузащите. Со своим приходом, он сместил своего нового одноклубника Эммануэля Эбуэ на роль правого полузащитника.
3 февраля 2008 года Бакари Санья стал автором голевой передачи на Эммануэля Адебайора в игре против «Манчестер Сити», которую «Арсенал» выиграл со счетом 3:1.
23 марта 2008 года Бакари забил свой первый гол в составе «Канониров». После подачи углового он зряче пробил головой в ворота лондонского «Челси». Однако этот гол не спас «Арсенал» от поражения со счётом 1:2.
1 августа 2010 года Санья забил гол в ворота шотландского «Селтика» в рамках кубка Эмирейтс. После розыгрыша углового Бакари из пределов штрафной мощно пробил по воротам. «Канониры» одержали победу со счетом 3:2 и одержали победу в кубке, а этот гол стал для французского защитника вторым в карьере.
14 ноября 2010 года в матче против Эвертона Санья, с передачи Аршавина, мощнейшим ударом в ближний угол заставил капитулировать голкипера Эвертона Тима Ховарда.
19 января 2011 года Санья отметился точным ударом во втором матче третьего раунда Кубка Англии против Лидс Юнайтед, чем помог своему клубу одержать победу (3:1) и пройти в следующий раунд.
2 октября 2011 года в матче с Тоттенхэмом получил перелом малой берцовой кости правой ноги и может пропустить три месяца.
Последнее обновление 28 августа 2010