В 1934 году Беллармино Багатти получил докторскую степень в папском Институте христинской археологии в Риме. С 1935 года работал во францисканском научно-исследовательском Институте Studium Biblicum Franciscanum в Иерусалиме, Израиль. Принял непосредственное участие в организации издания археологического ежегодника «SBF Liber Annuus» (издается с 1951 года) и книжной археологической серии «SBF Collectio Maior» (издается с 1941 года).
Беллармино Багатти участвовал в следующих археологических экспедициях: захоронение Коммодилли в Риме (1933—1934 гг.), Гора Блаженств (1936 г.), Церковь Посещения в Эйн Карем (1938 г.), Emaus Qubeibeh (1940—1944 гг.), Базилика Рождества в Вифлееме (1948 г.), Церковь Dominus Flevit в Иерусалиме (1953—1955 гг.), Назарет (1954—1957 гг.), Гора Кармель (1960—1961 гг.), Гора Нево (1935 г.) и Khirbet el-Mukhayyat (разные годы).
Беллармино Багатти опубликовал исследования, посвященные жизни христиан I века и апокрифам.
Беллармино Багатти умер 7 октября 1990 года в Иерусалиме и похоронен на францисканском кладбище на горе Сион.