Учился в реальном училище (1896—1903), затем — в школе прикладного искусства (1903—1905) в Праге. В 1906—1907 годах изучает живопись во Флоренции, затем возвращается в Прагу. В Праге впервые участвует в художественной выставке и вступает в группу художников Восемь («Osma»). После поездки в Париж в 1910 году художник участвует в подготовке выставки «независимых» в Праге.
В 1911 году Б.Кубишту в Праге посещают члены художественной группы Мост Эрнст Людвиг Кирхнер и Отто Мюллер. В августе того же года Б.Кубишта присоединяется к членам этой группы и в 1912 году принимает участие в выставках Зондербунда в Кёльне и Берлинской сецессион в Берлине. В годы Первой мировой войны художник был призван в австро-венгерскую армию; служил в Пуле, Вене, Яромерже, Любляне и в Словакии. За боевые заслуги был награждён орденом Леопольда.
Умер от испанки.
Эпилептичка (1912)
Гипнотизёр
Двойник (1911)
Пьеро (1911)
Променад в рижском саду
Объятия смерти (1912)
Автопортрет с закатанными рукавами (1904-05)
Воскрешение Лазаря
Вид на цементную фабрику в Бранике
Променад в Арно
Натюрморт (1909)
Променад II