Пьетро Томачелли был родом из Неаполя. Был кардиналом-диаконом Сан-Джорджио-ин-Велабро с 1381 года. Самый молодой папа римский XIV столетия. Через несколько лет после избрания Бонифация на трон Святого Петра в Авиньоне был провозглашён папой преемник Климента VII —- Бенедикт XIII. Раскол не только продолжался, но ещё более углублялся. На стороне авиньонских пап были королевские дворы Франции, Неаполя, Шотландии, отчасти Германии. Папу, пребывавшего в Риме, поддерживали Англия, Португалия и Венгрия. Другие страны сохраняли нейтралитет. Бонифаций IX не сделал ничего, чтобы ликвидировать схизму. В период его понтификата процветали непотизм, торговля индульгенциями и далеко зашедший куриальный бюрократизм. В 1391 году в Риме состоялась канонизация Бригитты Шведской.