По национальности бенгалец. Родился в Силигури, Дарджилинг, Западная Бенгалия в семье заминдара (землевладельца). В 1938 г. вступил в Коммунистическую партию Индии. В сороковые годы был одним из руководителей крестьянского движения за снижение арендной платы помещикам.
В начале 1960-х годов перешел на маоистские позиции, осудил хрущевскую политику. В 1962 г. во время индийско-китайского вооруженного конфликта был побит камнями антикитайски настроенной толпой, а затем арестован вместе с другими маоистски настроенными активистами Компартии.
В 1964 г., после отмежевания от Коммунистической партии Индии леворадикального маоистского крыла, оформившегося в Коммунистическую партию Индии (марксистскую), Мазумдар входит в состав последней.
22 апреля 1969 г., в день рожденья В. И. Ленина, была основана Коммунистическая партия Индии (марксистско-ленинская). Мазумдар был избран генеральным секретарем Центрального Оргкомитета партии. Мазумдар полагал, что авангардная революционная партия должна быть хорошо законспирированной, тайной и немногочисленной организацией. «Чтобы слиться с массами, партии не нужно самой становиться массовой и принимать в свои ряды кого попало, для этого достаточно лишь проводить линию масс», — утверждал он.
В период массовых крестьянских волнений и протестов против земельной политики властей Калькутты популярность КПИ(м-л) среди бенгальских крестьян небывало возросла. Тогда же произошло знаменитое восстание в Наксалбари, давшее название всему движению и жестоко подавленное правительственными войсками и полицией. Несмотря на то, что многие лидеры движения попали под арест, выводы из прежних ошибок были сделаны незамедлительно, и вскоре повстанческое движение наксалитов не только возобновилось на прежней территории, но и перекинулось на приграничные штаты. Наиболее обширная подконтрольная повстанцам зона образовалась в штате Андхра-Прадеш и включала в себя более 500 кв. миль т.н. «красных районов», соединенных узким коридором. Всего на территории штата Андхра-Прадеш действовало более ста партизанских отрядов, опиравшихся на поддержку местного крестьянства и племен. Партизанская война перекинулась также на штаты Карнатака, Орисса, Бихар и др.
Скрываясь от властей, Чару Мазумдар устанавливает контакты с лидерами радикального студенческого движения в Калькутте. Отношение Калькуттского студенчества к власти всегда было враждебным и в апреле 1970 года вылилось в массовые беспорядки против полуколониальной системы образования. В тот период Мазумдар организовывает переброску в город около трехсот опытных партизанских инструкторов, благодаря чему удалось обучить студентов военному делу и создать летучие отряды для ведения боя в «джунглях большого города». На участившиеся к концу года вооруженные акции городских партизан полиция ответила полномасштабными репрессиями: теперь активисты КПИ(м-л) не арестовывались при задержании, а расстреливались на месте. В ответ партия организовала серию нападений на полицейские участки и тюремные картежи с целью освобождения товарищей. Самой известной из серии подобных акций стал побег одиннадцати наксалитских лидеров из тюрьмы в Силигури 21 февраля 1970 г. Полиция была перепугана настолько, что жён и детей всех полицейских города свезли в центральные казармы, где те жили под усиленной охраной.
Организовать вооружённую борьбу рабочих Мазумдару не удалось, хотя некоторые предприятия поддержали восставших забастовка-ми. Зато городские низы всем сердцем поддержали вооружённую борьбу. Удалось развернуть успешную пропаганду идей КПИ(м-л) даже в уголовной среде. Однако, вскоре путем жестоких репрессий, внедрения в партийные ряды агентов и вербовки платных провокаторов и доносчиков, а также проведения массовых обысков,пыток и казней полиции удалось добиться значительного снижения активности повстанцев. К началу 1971 года движение в городе постепенно сходит на нет, притом, не переставая действовать и набирать силу в сельской местности.
16 июля 1972 года в Калькутте, после двух лет успешного ухода от полицейских преследований, Чару Мазумдар был схвачен. Данные о его местопребывании полиция вырвала под пыткой у одного из арестованных членов руководства КПИ(м-л). Через 12 дней после ареста Мазумдар скончался у себя в камере; согласно официальной версии, смерть наступила в результате сердечного приступа.