Джейсон О'Мара родился и вырос в Сэндиков (англ. Sandycove) в южном Дублине, Ирландия. Его родители — Вероника и Стивен О'Мара; у него есть брат Стивен и сестра Ребекка. В детстве Джейсон любил играть в регби и питал слабый интерес к актёрской игре, пока не был травмирован. После этого он решил попробовать себя в школьном спектакле и впоследствии стал активно участвовать различных постановках. Джейсон закончил Тринити Колледж со степенью бакалавра в области драмы и театра. Затем он переезжает в Лондон, где начинает играть на театральной сцене.
Женился на американской актрисе Пэйдж Тёрко (англ. Paige Turco) на римско-католической церемонии в штате Коннектикут, США, в сентябре 2003; у них есть один ребёнок. 26 января 2009 года он стал американским гражданином.