Джонаттан родился в Хантингтон-Бич, Калифорния. Джонни — младший брат одноклассника Синистера Гейтса, а The Reverend знаком с ним ещё с детства благодаря старшему брату. Учился в Marina High School в Хантингтон-Бич. За время учёбы познакомился со всеми участниками группы. Также хороший друг брата Заки Венджинса, Мэтта Бакера из группы The Dear & Departed.
Джонни заменил Дэмеона Эша когда выяснилось, что последний не в состоянии играть в группе. Получилось это случайно, Джон шёл по улице и увидел как в гараже у Мэтта группа репетирует. Посмотрев на то как играет группа, Джон дал группе о себе знать. Когда Эш вынужденно не смог продолжить участие в туре, Джонни пришёл в группу играть на басу. Результат не заставил себя ждать и он идеально влился в коллектив. После многочисленных концертов Джон был вынужден забросить высшую школу, чтобы продолжить турне с группой. Он выбрал карьеру музыканта.
Его 2 главных кумира — это Клифф Бёртон из Metallica и Дафф МакКаган из Guns'N'Roses. Стиль игры Джонни зависит от песни. В основном это, конечно же, быстрые песни, наподобие «Beast and the Harlot» и «Bat Country».