Дебютировал в декабре 1998 года. Долгое время боксировал против боксёров с нулевым рекордом.
В мае 2004 года состояля бой двух непобеждённых боксёров — Джозефа Агбеко и украинца Владимира Сидоренко. Решением большинства судей победил украинец.
В сентябре 2007 года Агбеко вышел на ринг против чемпиона мира в легчайшем весе по версии IBF никарагуанца Луиса Альберто Переса. Агбеко доминировал все раунды, выбрасывая значительное количество точных ударов. В перерыве межде 7-м и 8-м раундами врач осмотрел глаза Переса. Доктор сообщил что зрачки боксёра не отвечали, после чего бой был прекращён.
В декабре 2008 года (первончалально бой должен был состоятся в октябре 2008 года) Агбеко победил решением большинства Уильяма Гонсалеса.