Коидзуми — популярный политик, в 2005 ЛДП под его руководством получила парламентское большинство. Во внутренней политике сторонник реформ, уменьшения правительственного долга и приватизации почтовой службы. Внешняя политика при нём ознаменовалась ухудшением отношений с Китаем, Южной Кореей и Россией. Несмотря на протесты со стороны стран, оккупированных Японией в период Второй мировой войны, неоднократно посещал известный синтоистский Храм Ясукуни, в котором почитаются духи погибших в ходе войны японских солдат и военных деятелей, включая совершивших военные преступления. Неоднократно требовал возврата принадлежащих России островов Курильской гряды. Активно пропагандировал отправку японского контингента в Ирак. Выступал за изменение Конституции Японии с целью утвердить наследование императорского трона по женской линии.
Ознаменовал период своего правления экономическими реформами, в результате которых уже порядка миллиона японцев в настоящее время проживают на государственные пособия, включая также и значительное число бывших участников организованных бандформирований якудза. Наиболее масштабная из пропагандируемых Коидзуми реформ — приватизация государственной почтовой службы, которая одновременно входит в число крупнейших в Японии кредитных учреждений, конкурируя с коммерческими банками. Приватизацию почтовой службы Коидзуми называет «реформой реформ», поскольку «неэффективное расходование средств уменьшает доходы казны и загрязняет окружающую среду».
Склонен к дебатам и популистским публичным заявлениям, харизматичен, энергичный политик с хорошим имиджем. Выступил инициатором ряда назначений женщин на ответственные государственные посты, включая пост главы японского МИДа, занятый Макико Танакой. Разведён, имеет двоих сыновей. Рост 169 сантиметров, вес 60 кг. Выпускник престижного Университета Кэйо.
Коидзуми заранее объявил, что в 2006 он уйдёт в отставку с поста премьер-министра в соответствии с правилами ЛДП. Вопрос о преемнике Коидзуми долго оживлённо обсуждался в прессе. На обоих постах его сменил в сентябре 2006 г. Синдзо Абэ.