Родилась в семье Его Королевского Высочества Инфанта Хуана де Бурбона, графа Барселонского (1913—1993) и принцессы Марии де лас Мерседес Бурбон-Сицилийской (1910—2000). Внучка Короля Испании Альфонса XIII, сестра действующего испанского монарха Короля Хуана-Карлоса I и инфанты доньи Пилар.
В 1989 году, вместе с мужем, основала Культурный фонд герцогов Сориа. Вместе с супругом, возглавляют Попечительский совет фонда в качестве почётных президентов.
Является Почётным президентом Мадридской делегации в ЮНИСЕФ и Испанского фонда сердца и Испанской ассоциации гемофилии.
12 октября 1972 года сочеталась браком с доктором медицины Карлосом Эмилио Хуаном Зурита и Дельгадо (р. 1943).
У супругов двое детей:
Титул 2-ой герцогини Эрнани получила после смерти своего кузена, Манфреда де Бурбона, первого герцога Эрнани. Титул является наследственным, и будет передан старшему сыну герцогини.
Титул герцогов Сория получен как пожизненный титул супругов.
Полный официальный титул Инфанты доньи Маргариты: Её Королевское Высочество донья Маргарита Мария де ла Виктория Эсперанца Фелисидад Перпетуя де Тодос лос Сантос, инфанта Испании, герцогиня Сория, герцогиня Эрнани (исп. Su Alteza Real Do?a Margarita Mar?a de la Victoria Esperanza Jacoba Felicidad Perpetua de Todos los Santos, Infanta de Espa?a, Duquesa de Soria, Duquesa de Hernani).