Вступил на службу в 1791 году. В 1804 году сделан маршалом. До 1811 года Мортье командовал корпусом на Пиренейском полуострове, а в 1812 году ему вверено начальство над молодой гвардией. По занятии Москвы он назначен был её губернатором, и после ухода оттуда французов взорвал по приказанию Наполеона часть кремлёвских стен.
В 1814 году Мортье участвовал в обороне и сдаче Парижа.
После падения Империи Мортье был назначен пэром Франции, но в 1815 году перешёл на сторону Наполеона, за что, а главное — за объявление незаконным приговора над маршалом Неем, был Второй реставрацией лишён звания пэра (оно возвращено ему в 1819 году).
В 1832 году Мортье был короткое время послом при русском дворе; в 1834 году назначен военным министром и премьером (последнего поста лишился незадолго до гибели); в 1835 году убит «адской машиной» при покушении Фиески на жизнь короля Луи-Филиппа.