В двенадцатилетнем возрасте Эдуард Стэнли унаследовал по смерти своего отца Томаса Стэнли, второго графа Дерби, все его титулы и владения. До вступления юным графом в свои права в 1531 году, всё унаследованное имущество, за исключением вдовьей части его матери Анны Гастингс, находилось в распоряжении короля Генриха VIII. Ленные выплаты и доходы от управления имуществом Стэнли совокупно приносили в королевскую казну около 5500 фунтов стерлингов ежегодно, что было весьма значительной суммой. Поэтому опеку над юным наследником осуществляли виднейшие сановники английской короны, главным из которых был кардинал Томас Уолси, канцлер королевства.
С детства находясь при могущественном королевском советнике, Эдуард вскоре стал членом свиты Уолси, в качестве которого принял в 1528 году участие в его известном посольстве во Францию. В 1529 году Стэнли входил в число тех дворян, которые передали папе Клементу VII декларацию Генриха VIII о разводе с Екатериной Арагонской.
В 1529 или 1530 году влиятельный вельможа Томас Говард, третий герцог Норфолк, договорился с Эдуардом о браке последнего с его дочерью — Катериной Говард. Брак считался утверждённым после его одобрения королём, которое после некоторых сложностей было даровано Генрихом. Однако, в течение нескольких недель после венчания Катерина заразилась чумой и умерла. Норфолк и Дерби не были обескуражены, и практически сразу же сговорились о второй женитьбе Эдуарда Стэнли на сводной сестре Норфолка — Дороти Говард.
В 1532 году третий граф Дерби сопровождал Генриха VIII на его встрече с французским королём Франциском I, проходившей в Булони. Вскоре после этой встречи Эдуард Стэнли был посвящён в рыцари Бани. В 1536 и 1537 годах Стэнли был одним из руководителей мероприятий по подавлению Благодатного паломничества, народного восстания, возникшего против английской реформации и охватившего Линкольншир, а затем и всю Северную Англию. В 1542 году Стэнли участвовал вместе с родственником — герцогом Норфолком в походе последнего в Шотландию.
При вступлении на престол Англии Эдуарда VI в 1547 году Эдуарда Стэнли посвящают в кавалеры ордена Подвязки. В 1550 году Дерби входит в число пэров, принимавших участие в согласовании мирного договора с Францией и Шотландией. Однако уже следующий год несёт существенные перемены его статуса — ему было высочайше рекомендовано упразднить своё владение островом Мэн, на что лорд ответил отказом и приготовился к вооружённому сопротивлению. Причиной подобной опалы, как правило, указывают крайне консервативные религиозные взгляды Эдуарда Стэнли, находившегося в оппозиции к радикальному протестантскому законодательству Эдуарда.
Как бы то ни было, восшествие на престол католички Марии I вернуло графу Дерби расположение короны, он получил звание Лорда Верховного Стюарта Англии и стал тайным советником королевы. Он был назначен комиссаром на судебном процессе над Джейн Грей и другими еретиками.
После очередной смены монархов в 1558 году, Эдуарду Стэнли удалось получить благоволение и Елизаветы I, поскольку он был одним из тех, кто призывал встречать новую королеву при её въезде в Лондон. Елизавета сохранила за ним должность в тайном совете, а затем назначила своим лордом-лейтенантом в Чешире.
Эдуард Стэнли умер в 1572 году в своем имении Латом в графстве Линкольншир, оставив в качестве наследника своего старшего сына Генри Стэнли.