Начала заниматься волейболом в СДЮШОР № 3 города Иваново. Первый тренер — Л. Ф. Чебунина. Выступала за команды: 2001—2004 — «Олимпия» (Шуя), 2004—2006 — «Динамо» (Москва), 2006—2007 — ЦСКА (Москва), 2007—2009 — «Ленинградка» (Санкт-Петербург), 2009—2010 — «Динамо» (Краснодар). С 2010 года — игрок команды «Динамо-Казань».
В составе московского «Динамо» стала чемпионкой России 2006, серебряным призёром российского первенства 2005, бронзовым призёром Кубка России 2005, финалисткой розыгрыша Кубка топ-команд 2006.
В составе ЦСКА становилась серебряным призёром чемпионата России 2007, Кубка России 2006 и Кубка топ-команд 2007.
В составе «Ленинградки» — бронзовый призёр Кубка вызова 2009, в составе краснодарского «Динамо» — бронзовый призёр чемпионата России 2010. С казанским «Динамо» в сезоне 2010/11 выиграла Кубок и чемпионат России, была признана лучшей либеро «Финала четырёх», в сезоне-2011/12 — серебряную медаль Кубка России и приз лучшей принимающей «Финала четырёх», бронзовую медаль Лиги чемпионов.
В 2003—2005 годах Екатерина Кабешова выступала за юниорскую и молодёжную сборные России. В 2004 году стала бронзовым призёром чемпионата Европы среди молодёжных команд. Также принимала участие в чемпионатах мира и Европы среди девушек 2003 и чемпионате мира среди молодёжных команд 2005.
С 2005 года Екатерина Кабешова входит в национальную сборную России. В её составе участвовала в Олимпийских играх 2008, Мировом Гран-при 2007 и 2009, чемпионатах Европы 2005, 2007 и 2009. Серебряный призёр Гран-при 2009, бронзовый призёр европейских первенств 2005 и 2007.
В ноябре 2010 года стала чемпионкой мира в составе сборной России.