Халилов Эльчин Нусрат оглы родился в 1959 г. в г. Баку в известной в Азербайджане семье геолога-нефтяника. Его отец Халилов Нусрат Юсиф оглы — доктор геолого-минералогических наук, профессор, заслуженный геолог Азербайджана, удостоен президентской пенсии. Мать — Халилова Рена Гусейн кызы, известный педагог-врач с сорокалетним стажем преподавания в Азербайджанском педагогическом университете. Его дед — профессор, доктор медицинских наук Агабеков Гусейнбек, был известным ученым в области гинекологии, заведовал кафедрой гинекологии Азербайджанского Медицинского Института, участвовал во второй мировой войне, награждён многочисленными государственными орденами и медалями. Его прадед — известный ученый — востоковед, профессор Агабекзаде, Садых-бек, в начале 20-го века был на службе в царской армии в чине генерал-майора. В 1918—1919 годах генерал Садыхбек Агабекзаде был первым заместителем Министра внутренних дел в новом демократическом правительстве Азербайджана и в этот период он несколько месяцев также исполнял обязанности Министра Обороны Азербайджана. Демократическое правительство Азербайджана действовало до вступления Азербайджана в Советский Союз (до 1920 года). Впоследствии генерал и профессор Гусейнбек Агабекзаде эмигрировал за рубеж и долгое время проживал в Стамбуле (Турция) и в Париже. В Париже Гусейнбек Агабекзаде работал профессором в Сорбоннском Университете и преподавал востоковедение. В этот период он написал несколько монографий на французском языке в области востоковедения. Он ушел из жизни работая профессором в Краковском университете в Польше. Его именем названа одна из улиц в г. Львове (в тот период г. Львов был в составе Польши).
Профессор Эльчин Халилов продолжил семейную традицию и с детства имел большой интерес к знаниям и науке. Он окончил Азербайджанский институт нефти и химии им. М.Азизбекова (ныне Азербайджанская государственная нефтяная академия) в 1981 г. по специальности «геофизика». К моменту окончания университета Э.Халилов уже имел пять опубликованных научных работ в сборниках для молодых ученых. После завершения университета он поступил в аспирантуру и с 1981 по 1984 годы являлся аспирантом института геологии им. И. М. Губкина Академии Наук Азербайджана.
В 1984 году защитил кандидатскую диссертацию в области геотектоники (приравнивается к ученой степени PhD). В том же году за свои научные исследования ему была вручена самая высокая награда для молодых ученых Азербайджана — Премия Ленинского Комсомола Азербайджана в области науки и техники (1984). В 1990 г. он защитил докторскую диссертацию в Московском государственном университете имени М. В. Ломоносова в области изучения и прогнозирования землетрясений и извержений вулканов и получил высшую ученую степень — доктора геолого-минералогических наук.
В 1984 году за научные исследования в области геодинамики и геотектоники Эльчин Халилов удостоен звания «Лауреат Премии Ленинского Комсомола Азербайджана в области науки и техники» (высшая награда для молодых ученых Азербайджана). Халилову Э. Н. вручен диплом за первое официально утвержденное научное открытие в истории Азербайджана под названием «Закономерность пространственно-временного распределения извержений вулканов» с датой приоритета от 20 сентября 1983 г., которое было внесено в международный регистр открытий. Открытие было сделано Э. Н. Халиловым в соавторстве с академиком Национальной Академии Наук Азербайджана Ш. Ф. Мехтиевым, академиком АН СССР и РАН В. Е. Хаиным и академиком РАЕН Т. А. Исмаил-Заде.
В 2001 году Халилов Э. Н. был награжден медалью «Лауреат ВВЦ» Всероссийского Выставочного Центра. В 2002 году Халилову Э. Н. за научные заслуги был вручен «Золотой Нагрудный Знак имени Лауреата Нобелевской Премии Павлова» — высшая награда Международной Академии Наук (октябрь, 2002, Бразилия, г. Сан-Паулу). За научное открытие в 2003 году Халилову Э. Н. вручена серебряная медаль «Автору научного открытия» имени Лауреата Нобелевской Премии П. Н. Капица.
Профессор Эльчин Халилов активно участвует в редакторской деятельности в составе редакционных советов научных изданий. В 2004, в 2006 и 2009 годах были изданы фундаментальные многотомные издания «НАУКА БЕЗ ГРАНИЦ» (Труды Международной Академии Наук (Здоровье и Экология)), Тома 1-3, 2003/2004, 2005/2006 и 2007/2008) под редакцией Президента Международной Академии Наук Вальтера Кофлера и Эльчина Халилова. С 2006 г. он является членом редколлегии журнала «Вестник Международной Академии Наук» (г. Москва, Россия). С 2010 г. Председатель Редколлегии Международного Журнала «GEOCHANGE: Problems of Global Changes of the Geological Environment». С 2009 г. Сопредседатель Редакционного Совета журнала Scientific Bulletin of WOSCO Лондон, Англия).
В 2007 г. он избран академиком Российской академии естественных наук (РАЕН). С 2008 г. член Американской Ассоциации Научного Развития (AAAS) и Вице-Президент WOSCO (Всемирная Организация по Научному Сотрудничеству). C 2009 г. Председатель Международного Комитета по Глобальным Изменениям Геологической и Окружающей Среды (Мюнхен,Германия). C 2011 г. Председатель Правления Всемирная Организация по Научному Сотрудничеству.
В общей сложности профессором Халиловым опубликовано более 250 научных трудов, в том числе 7 монографий и более 300 научно-популярных статей в журналах и газетах. Ниже приводится список наиболее важных публикаций Э. Н. Халилова за последние 6-ть лет.
Халилов Эльчин принимал участие во многих международных конференциях, проведенных в следующих странах: Англия, Австрия, Германия, Бразилия, Россия, Испания, Бельгия, Индонезия, Пакистан, Турция, Болгария, Иран, Кипр, Чехия, Китай, Словакия, Украина, Казахстан, Объединённые Арабские Эмираты, Саудовская Аравия и других.
Автобиография Эльчина Халилова опубликована в книге «Известные Учёные Азербайджана», в энциклопедии «Геофизики Азербайджана: Кто есть кто», в международных биографических справочниках в г. Кембридж, в книге «100 лидеров промышленности и науки Содружества (СНГ)», в энциклопедической информационной книге «Кто есть кто в Азербайджане», в книге «Азербайджанская Секция МАН (Международная Академия Наук (Здоровье и Экология))» и др.
Э. Н. Халилов — соавтор единственного официально зарегистрированного научного открытия в Азербайджане, восьми международных патентов на изобретения (PCT), одного ЕВРОПАТЕНТА, пяти евразийских патентов и более сорока национальных патентов Азербайджана, Пакистана, Индонезии и других стран.
Э. Н. Халилов — автор более 250 опубликованных научных статей, шести монографий и более 300 научно-популярных публикаций.