Вместе с братом Фёдором Бондарчуком воспитывалась бабушкой Скобцевой Юлией Николаевной (1904—1999).
Окончила Школу-студию МХАТ в классе педагога Е. А. Евстигнеева.
Снявшись в нескольких фильмах в 80-е годы, Алена сосредоточилась на работе в театре. Она работала в Театре имени А. С. Пушкина, затем в Театре имени Моссовета. С 1998 года Алёна Бондарчук — одна из ведущих актрис МХАТа имени А. М. Горького.В 2003 году пришла работать в частный театр Империя Звёзд.
Скончалась от рака 7 ноября 2009 года в Москве на 48 году жизни. Елену (Алёну) Бондарчук похоронили 10 ноября 2009 года на Новодевичьем кладбище в Москве рядом с отцом Сергеем Бондарчуком.
Во МХАТе им. Горького, Пушкинском театре, театре Моссовета,театре Империя звёзд:
Со спектаклем «Дорогая Елена Сергеевна» ездила на гастроли в Америку. Играла в спектаклях «Оскар» (реж. Пётр Штейн) роль Мадам Барнье,«Трамвай«Желание»(реж.Александр Марин) роль Бланш.