Эмилия Шанкс родилась 1 августа 1857 года в Москве в семье британского предпринимателя Джеймса-Стюарта Шанкса (англ. James Stewart Shanks), владельца ювелирной мастерской и основателя торгового дома «Английский магазин Шанкса и Болина», одного из самых фешенебельных магазинов Москвы на Кузнецком Мосту. Двое из восьми детей Джеймса-Стюарта Шанкса — Эмили и её младшая сестра Мэри (Мария Яковлевна Шанкс — иллюстратор произведений Л.Н. Толстого) стали профессиональными художницами.
С 1882 в качестве вольнослушательницы училась в Московском училище живописи, ваяния и зодчества у В.Е. Маковского, И.М. Прянишникова в мастерской В.Д. Поленова. Окончила училище в 1890 с присвоением звания классного художника. Награждена большой серебряной медалью МУЖВЗ за картину «Письмо няни».
С 1891 экспонент Товарищества передвижных художественных выставок. В 1894 за полотно «Чернильное пятно» была включена в члены Товарищества и стала первой из двух женщин-живописцев, удостоенной этой чести.
Участвовала во Всероссийской промышленной и художественной выставке в Нижнем Новгороде, выставках Московского общества любителей художеств (1900–1901), в галерее Лемерсье (1909–1912) в Москве. После переезда в Лондон в 1913 году, выставляла свои работы в Лондонской Королевской Академии художеств (1916, 1918).
Отличительная черта жанровой живописи Эмилии Шанкс — обязательное присутствие на полотнах детей: «Старший брат», «Трудная задача», «Любимая кукла», «Наём гувернантки», «Мыльные пузыри», «Гостья в институте». Картину «Новенькая в школе» приобрёл для своей коллекции в 1892 году П.М. Третьяков. Эмилия Шанкс скончалась в 1936 году в Лондоне, округ Кенсингтон.
thumb|«Медицинский осмотр в русской богадельне», (межд. 1880-1900), холст, масло, Челмсфордский музей, Эссекс, Великобритания.
«Девочка», (межд. 1880-1915), холст, масло — частное собрание.
«Наём гувернантки», (ранее 1913), холст, масло — Тюменский областной музей изобразительных искусств.
«Девочка, собирающая огурцы», (ранее 1936), холст, масло — частное собрание.
«Любимая кукла», (ранее 1936), доска, масло — частное собрание.
«Новенькая в школе», (1892), холст, масло — Государственная Третьяковская галерея.