Эмма происходила из рода, который возвысился благодаря браку её старшей сестры, Юдит, с императором Людовиком I Благочестивым, который был заключён в 819 году. В 827 году Эмма, в свою очередь, вышла замуж за пасынка своей сестры — Людовика Немецкого, сына императора Людовика от первого брака. Этот брак императрица Юдит организовала для примирения хотя бы с одним из пасынков, а также для увеличения влияния своей семьи. Людовик Немецкий в это время был королём Баварии, в которой род Вельфов имел владения.
Этот союз не помешал Людовику Немецкому восстать вместе со старшим братом Лотарем против отца. Но после смерти императора Людовика Благочестивого Людовик Немецкий объединился против Лотаря со сводным братом Карлом (сыном Юдит). После победы в битве при Фонтенуа три брата заключили Верденский договор, благодаря которому Людовик Немецкий стал королём Восточно-Франкского королевства.
Эмма умерла 31 января 876 года и была похоронена в бенедиктинском аббатстве в Регенсбурге, основанном святым Эммерамом. Её муж умер через полгода.
Муж: с 827 Людовик II Немецкий (ок. 806 — 28 августа 876), король Баварии 817—843, король Восточно-Франкского королевства с 843 года
Французский историк Жан-Ноэль Матьё, рассматривая происхождение Ангельберги, жены императора и короля Италии Людовика II, выдвинул гипотезу о том, что матерью Ангельберги могла быть Эмма Баварская. Эту гипотезу он обосновывал документами сыновей Эммы, Карломана и Карла III Толстого, которые называют Ангельбергу «сестра» (лат. soror). На основании этого он предложил, что Ангельберга была их единоутробной сестрой, дочерью Эммы от гипотетического первого брака, который должен был состояться до 827 года, когда Эмма вышла замуж за Людовика Немецкого.
Для того, чтобы определить возможного мужа Эммы, Матьё прибег к ономастическим данным. Он обратил внимание на то, что начиная с детей Ирменгарды, дочери Ангельберги, в роду появляется имя Вилла/Гилла (лат. Willa/Guille). Для того, чтобы объяснить происхождение этого имени, Матьё предположил, что это женское имя является производными от Гильом (Вильгельм) и свидетельствуют о родстве со знатным родом Гильемидов. Если эта гипотеза верна, то первый муж Эммы должен был принадлежать к роду Гильемидов и умереть незадолго до 827 года. Матьё предложил идентифицировать отца Ангельберги с графом Отёна Тьерри III, сыном графа Тулузы Гильома Желонского. Однако у этой гипотезы есть и проблемы. В грамоте императора Людовика II его архиканцлер Суппо III назван двоюродным братом (лат. consobrinus) Ангельберги. Для объяснения родства Ангельберги с Суппонидами, Матьё предположил, что из этого рода происходила Кунигунда, первая жена Гильома Желонского, отца Терри III. Суппониды также состояли в родстве с королём Италии Бернаром, жена которого, Кунигунда, возможно была внучкой Гильома Желонского. Однако Тьерри III традиционно считается сыном Гильома Желонского от второго брака, и тогда Ирментруда не могла быть родственницей Суппонидов.