С 12 лет Эмре занимался в клубе «Зейтынбурнуспор», с 14-ти — в юношеской команде «Галатасарая». Немало для карьеры Эмре сделал тогдашний главный тренер стамбульцев Фатих Терим. В конце сезона 1996/97 при счете 2:2 в матче с «Бешикташем» он выпустил Эмре на замену и тот забил победный мяч, принеся «Галатасараю» победу и чемпионство. Всего за пять лет Эмре выиграл в составе «Галатасарая» четыре чемпионата страны, три кубка страны, Кубок УЕФА и Суперкубок УЕФА.
Игроком заинтересовался миланский «Интер» и ряд других клубов. Сезон 2001/02 Белёзоглу начал в Италии. Там он получил прозвище «Босфорский Марадона». Эмре отыграл немало матчей за миланский клуб, выиграл с ним Кубок Италии, в сезоне 2002/03 был признан лучшим футболистом «Интера». В сезоне 2004/05 редко выходил на поле по причине многочисленных травм.
В 2004 году был включён в список ФИФА 100 (одно из самых неоднозначных включений в список).
В 2005 году турок перешёл в «Ньюкасл Юнайтед» за 3,8 миллиона фунтов. Полностью раскрыться в английской команде ему помешали травмы.
Эмре — игрок сборной Турции с 2000 года. Он добился с ней 3-го места на чемпионате мира-2002 в Японии и Корее. Всего за национальную команду провел более 70 матчей.
В Англии Эмре 3 раза обвинялся в расистских высказываниях. После стыковых игр со Швейцарией за право выхода на ЧМ-2006 за драку был дисквалифицирован на 6 матчей. Позже ФИФА сократила срок до 4 матчей. Эмре зарекомендовал себя как чересчур импульсивный игрок.
В июле 2008 года Эмре подписал четырёхлетний контракт с турецким «Фенербахче». Детали контракта не разглашались.
Прадед Эмре — Белез выходец из дагестанского села Мискинджа, лезгин по национальности. В 18-летнем возрасте Белез после пленения имама Шамиля перебрался в Стамбул принял османское гражданство, поступил на военную службу и вскоре женился.