Родился 6 марта 1965 года в селе Давыдовцы Черновицкой области, УССР.
По окончании средней школы поступил в Черновицкое музыкальное училище, которое закончил в 1983 году.
В 1985 году зачисляется в число братии Свято-Духовского мужского монастыря Вильнюса.
В 1988 году по просьбе архимандрита Ионафана (Елецких), наместника Киево-Печерской Лавры, послушник Свято-Духовского монастыря переведен в эту обитель, где и был пострижен в монахи с именем Агапит — в честь преподобного Агапита Печерского, врача безвозмездного.
В 1988 году рукоположен в иеродиаконы, а в 1990 году — в иеромонахи.
22 июня 1994 года указом предстоятеля Украинской Православной Церкви митрополита Владимира игумен Агапит назначен наместником Свято-Троицкого мужского монастыря.
В 1994 году закончил Киевскую духовную семинарию.
В 1998 году — академию, защитив работу на тему «Роль Вселенских и Поместных Соборов в формировании христианского богослужения».
В ноябре 1998 года решением Священного Синода Украинской Православной Церкви архимандрит Агапит назначен епископом Хустским и Виноградовским.
Хиротония во епископы произошла 22 ноября 1998 года в Трапезном храме Киево-Печерской Лавры.
26 июля 2000 года назначен епископом Мукачевским и Ужгородским.
С 14 декабря 2007 года — епископ Северодонецкий.