Окончил Саратовскую духовную семинарию в 1888 году, Казанскую духовную академию со степенью кандидата богословия в 1892 году.
С 26 февраля 1917 года — епископ Соликамский, викарий Пермской епархии. Во время пребывания пермского архиепископа Андроника (Никольского) на Поместном Соборе в августе-декабре 1917 год и в январе-апреле 1918 года епископ Феофан исполнял его обязанности по управлению епархией. 4 февраля 1918 года он возглавил в Перми небывало многолюдный крестный ход, устроенный в связи с гонениями на церковь.
Вернувшись в Соликамск, выступал против национализации церковной собственности. Когда в 1918 году волостной земельный отдел «просил» Троицкий монастырь в Соликамске прислать планы сенокосных лугов для дальнейшего их изъятия, владыка ответил:
«…предстанет Страшному Суду Всемогущего Бога всякий, кто осмелится для чего-либо захватывать принадлежащие Церкви земельные угодья и какое-либо достояние Церкви Божией. Без разрешения власти архиерея, Преосвященного Андроника, не имею права разрешать высылать планы…».
Современники свидетельствовали о епископе Феофане как о великом молитвеннике и постнике, простом, открытом, внимательном к нуждам людей пастыре, бесстрашном обличителе безбожия.
22 июня 1918 года, после после ареста и казни архиепископа Андроника, вступил в управление Пермской епархией. В конце лета был арестован.
24 декабря 1918 года, за несколько дней до занятия Перми войсками адмирала А. В. Колчака, был казнён большевиками. Перед смертью подвергнут изощрённым мучениям. Чекисты раздели епископа донага и в тридцатиградусный мороз многократно погружали его в ледяную прорубь реки Камы. Тело владыки покрылось льдом толщиной в два пальца, но мученик всё ещё оставался жив. Тогда палачи его просто утопили. Вместе с ним были утоплены два священника и пять мирян.
На Архиерейском Соборе 2000 года священномученик Феофан и убиенные вместе с ним священники и миряне были причислены к лику святых.
24-25 декабря 2005 года в Перми в память священномученика Феофана прошли Феофановские чтения по теме: «Духовное образование в Пермском крае: история, современность, перспективы». Участниками Чтений стали представители власти, духовенства, деятели культуры и образования, а также учащиеся различных учебных заведений города Перми. С приветственным словом перед участниками Чтений выступил епископ Пермский и Соликамский Иринарх.