Родился в городе Воронеже.
Образование получил в Киевской духовной академии.
По окончании академического курса — проповедник в Киево-Печерской лавре и начальник лаврской канцелярии.
В 1768 году назначен главным священником в армии графа Румянцева в г. Глухове.
30 января 1773 года возведен в сан архимандрита Киево-Межигорского монастыря.
В 1775 году переведен в Макариев Троицкий Калязин монастырь Тверской епархии.
17 июля 1776 года хиротонисан в Москве во епископа Переяславского, викария Киевской епархии.
В 1783 году (по смерти митрополита Гавриила) временно управлял Киевской митрополией.
27 июля 1785 года — епископ Новгород-Северский и Глуховский.
1 сентября 1797 года — епископ Белорусский и Могилевский, но по назначению не поехал.
24 октября 1797 года уволен на покой с сохранением жалованья и правом управления Новгород-Северским монастырем.
Епископ Иларион отличался твердым, энергичным характером и строго наблюдал за своими подчиненными.
Скончался 12 января 1799 года.