Родился 18 апреля 1969 года в городе Николаеве в семье верующих.
9 июня 1969 года был крещен в Николаевском храме в честь Всех святых с именем Иоанн.
В 1976 году начал учиться в средней школе № 14 города Николаева.
В 1980 году, после переезда в город Брянка Луганской области, перешел в среднюю школу № 10, которую окончил через шесть лет.
Обучение продолжил в СПТУ № 18, которое окончил с отличием в июле 1987 года.
С июля 1987 года до июня 1988 года работал в Ленинской геологоразведочной экспедиции помощником бурильщика.
19 июня 1988 года призван в ряды Советской армии. Службу проходил в Саратове. Уволен в запас 29 мая 1990 года.
В 1990 году поступил в Киевскую духовную семинарию.
В 1993 году окончил ее с отличием и поступил в Киевскую духовную академию, которую в 1997 году также окончил с отличием.
С 1996 года — преподаватель Киевской духовной семинарии.
18 марта 1999 года успешно защитил кандидатскую диссертацию на тему «Религиозно-эстетичные воззрения Древней Руси в досинодальный период» за которую удостоен степени кандидата богословия.
В 1999 году назначен преподавателем Киевских духовных школ по богословским дисциплинам «Моральное богословие», «Церковнославянский язык», «Религиозная этика» и «Православная экклезиология».
С 1999 года — член Ученого совета Киевской духовной академии и ответственный секретарь «Трудов Киевской духовной академии».
В священном сане с 2000 года.
В августе 2000 года назначен руководителем издательского отдела Киевской митрополии.
В 2001 году ко дню Святой Пасхи по благословению митрополита Владимира возведен в сан игумена.
С 2002 года преподавал курс «Основы христианской морали» и возглавлял кафедру богословия, образованную на базе Украино-Азербайджанского института социальных наук и международных отношений им. Г. А. Алиева в Международной академии управления персоналом.
С марта 2003 года — член постоянно действующей комиссии по вопросам этики при Государственном центре иммунобиологических препаратов.
21 ноября 2003 года по благословению митрополита Киевского Владимира возведен в сан архимандрита.
28 января 2005 года назначен секретарем Ученого совета Киевских духовных школ, 30 марта 2007 года — их проректором.
10 июня 2007 года решением Священного Синода Украинской Православной Церкви и назначен секретарем синодального Учебного комитета.
29 июля 2007 года митрополитом Киевским Владимиром был рукоположен в сан епископа Северодонецкого и Старобельского в Трапезном храме Киево-Печерской Лавры.
Решением Священного Синода Украинской Церкви от 14 декабаря 2007 года был переведен на Сумскую кафедру.
8 мая 2008 года на очередном заседании Украинский Священный Синод заслушал объяснение епископа Илария и прежнего настоятеля Сумского Спасо-Преображенского кафедрального собора протоиерея Георгия Бавикина и решил: «Во имя Воскресшего Спасителя призывать обе стороны к примирению на взаимоприемлемых условиях. В случае продолжения конфликта принять соответствующие решения Священного Синода на основании канонических правил Православной Церкви».
Синодальным решением от 11 ноября 2008 года была признана виновность протоиерея Бавикина, запрещенного в священнослужении на три года, а епископ Иларий был перемещен на Херсонскую и Таврическую кафедру (Журнал №103). Тогда же он был назначен на должность главы Синодального отдела религиозного образования и катехизации УПЦ (Журнал № 104).
17 ноября 2008 года синодальным решением он был назначен епископом Макаровским, викарием Киевской митрополии (Журнал заседания №108). Тем же решением Синод Украинской Церкви благословил открытие Катехизаторско-регентского духовного училища и иконописной школы в Киевской епархии, чьим ректором был назначен епископ Иларий (Журналу №109).