Родился 1 января 1942 года в Липецке. В семье у него были три сестры. Его родителям принадлежали две ветряные мельницы, большой сад, 2-этажный дом из тёсаного камня. Учился в школе села Тюшевка.
После окончания работал в цехах завода «Свободный сокол».
С 1961 по 1964 год служил в рядах Советской Армии. В 1965 году вернулся работать на завод и одновременно учился в вечерней школе.
В 1973 году поступил на второй курс Одесской духовной семинарии, которую окончил в 1976 году.
9 сентября 1976 года рукоположён в сан диакона (целибат) епископом Воронежским и Липецким Ювеналием (Тарасовым) в Покровском кафедральном соборе города Воронежа.
10 сентября 1976 года рукоположен в сан иерея в Троицом соборе города Задонска епископом Воронежским и Липецким Ювеналием и назначен настоятелем Покровской церкви села Павловка Добринского района Липецкой области.
В 1978 году поступил в Московскую духовную академию на заочный сектор.
21 марта 1980 года принял монашеский постриг с именем Никон.
Ко дню Святой Пасхи 1982 года возведён в сан игумена.
В 1983 году окончил курс Московской духовной академии по первому разряду, написав дипломную работу «Сущность покаяния по учению святого Иоанна Лествичника».
В 1990 году митрополитом Воронежским и Липецким Мефодием (Немцовым) возведён в сан архимандрита.
31 октября 1990 года назначен духовником Алексиево-Акатова монастыря города Воронежа.
С 1 июля 1991 года — наместник Задонского Рождество-Богородицкого мужского монастыря.
27 декабря 1995 года постановлением Священного Синода определено быть епископом Задонским, викарием Воронежской епархии.
31 марта 1996 года хиротонисан во епископа Задонского, викария Воронежской епархии.
В 1998—2002 годах был секретарём Воронежско-Липецкой епархии по Липецкой области.
7 мая 2003 года постановлением Священного Синода в связи с образованием новой Липецкой и Елецкой епархии, стал викарием последней с поручением временного управления новообразованной епархией.
26 декабря 2003 года постановлением Священного Синода назначен епископом Липецким и Елецким.
1 февраля 2011 года возведён в сан архиепископа.