Родился в Саратовской губернии в семье священника.
Первоначально обучался в Саратовской духовной семинарии, потом поступил в Московскую духовную академию.
12 октября 1841 года пострижен в монашество; 19 октября рукоположен во иеродиакона. С 30 июля 1844 года — иеромонах.
12 декабря 1844 года по окончании духовной академии определён учителем Иркутской духовной семинарии.
15 ноября 1845 года удостоен ученой степени кандидата богословия и назначен инспектором Иркутской духовной семинарии.
6 октября 1852 года возведён в сан архимандрита.
16 октября 1855 года назначен ректором Иркутской духовной семинарии.
С 15 января 1857 года — ректор Новоархангельской духовной семинарии на острове Ситхе.
29 марта 1859 года хиротонисан во епископа Новоархангельского, викария Камчатской епархии.
9 ноября 1866 года перемещен епископом Якутским, викарием той же епархии.
3 июля 1867 года уволен на покой по болезни.
С 13 октября 1867 года — член Московской Синодальной конторы и управляющий Воскресенским Ново-Иерусалимским монастырем.
4 апреля 1869 года назначен епископом Уфимским и Мензелинским.
С 19 ноября 1876 года — епископ Томский и Семипалатинский.
9 июля 1883 года вторично уволен на покой в Оптину пустынь Калужской епархии.
С 11 февраля 1885 года управлял Московским Заиконоспасским монастырём.
10 июля того же года назначен членом Московской Синодальной конторы, а 9 августа — управляющим Московским Новоспасским монастырём.
Скончался 27 мая 1889 года.
Из его печатных трудов наиболее известны сочинения о монашестве, а затем поучения и миссионерские известия. Свои сочинения он пожертвовал в пользу Оптиной пустыни.
Епископ Петр был постоянным членом Комитета по распространению духовно-нравственных книг.