Происходил из старинного священнического рода. Отец — Василий Николаевич Пляскин, протоиерей Омской епархии. Мать — Анна Михайловна. Двоюродный дед по линии матери — первый епископ Омский и Семипалатинский Григорий (Полетаев).
Окончил первую омскую гимназию с золотой медалью. Подал документы в Казанскую духовную академию, однако из-за гражданской войны не смог получить высшее образование. Весной 1919 был призван в армию адмирала А. В. Колчака, учился в первом Сибирском военном артиллерийском училище, в 1920 во Владивостоке был произведён в подпоручики, но вскоре уволен с военной службы. В 1920—1927 жил во Владивостоке, занимался репетиторством.
В 1926—1927 годы — иподиакон и личный секретарь епископа Владивостокского Киприана (Комаровского).
В 1927—1930 годы — помощник секретаря Омского епархиального совета.
В 1927—1928 годы — иподиакон епископа Омского Виктора (Богоявленского).
В 1928—1930 годы — иподиакон и личный секретарь епископа Омского Аркадия (Ершова).
27 мая 1930 года был пострижен в монашество, с 28 мая 1930 — иеродиакон.
С 29 мая 1930 года — иеромонах, служил в Знаменском храме Омска.
В 1935 году служил в храме во имя преподобного Михаила Клопского, а затем в Свято-Михайловском храме в Омске.
С 1936 года — игумен.
В 1937 году был арестован, до 1941 находился в заключении в Тюмени.
В 1942—1943 годы служил в Красной армии. Участник Великой Отечественной войны. Был демобилизован после тяжёлой болезни по инвалидности.
В феврале 1944 — марте 1945 года — настоятель Никольского храма Омска.
В марте 1945 — январе 1946 — благочинный храмов Омской области, служил в Крестовоздвиженском соборе Омска.
С 30 января 1946 года — епископ Хабаровский и Владивостокский. Проявил себя строгим, требовательным архипастырем, что вызвало жалобы, приведшие к его увольнению на покой (10 июля 1947).
С 3 июня 1948 года — епископ Петрозаводский и Олонецкий. 4 марта 1949 вновь уволен на покой.
С 1 сентября 1955 по 22 ноября 1956 — временно управляющий Омской епархией. В этот период по его распоряжению из дома епархиального управления были убраны телевизор и радио, к которым владыка относился резко отрицательно.
С 13 мая по 16 июля 1958 — вновь временно управляющий Омской епархией.
С 3 апреля 1961 по 13 июня 1962 — в третий раз временно управлял Омской епархией.
В июне 1962 был в очередной раз уволен на покой — это решение было связано с недовольством его активной деятельностью со стороны органов советской власти. Так, управляя Омской епархией, владыка Венедикт в 1961 посетил все её приходы, а в следующем году совершал поездки по епархии, не ставя о них в известность местного уполномоченного Совета по делам религий (тогда это считалось обязательным).
После увольнения на покой остался жить в Омске. Вёл переписку с многочисленными духовными чадами. Похоронен на Восточном кладбище города.
По воспоминаниям современников, владыка Венедикт