Эрколе (Эркюль) д’Эсте родился в Ферраре, в семье Никколо III д'Эсте (1383—1441), маркиза Феррары и сеньора Модены и его третьей супруги Риччиарды ди Салюццо (ум. 1474). Будущий герцог Феррары и Модены получал образование при дворе Альфонсо V, короля Арагонского и Неаполитанского, где провел 15 лет — с 1445 по 1460 год. Эрколе освоил там не только военные искусства и рыцарские добродетели, но также сделался большим знатоком античной архитектуры и изящных искусств, что в дальнейшем немало способствовало его репутации ценителя и покровителя итальянского Возрождения.
В 1471 году, после смерти своего сводного брата Борсо, Эрколе становится герцогом Феррарским. Позже, в 1473 году он вступает в брак с Элеонорой Арагонской, внучкой Альфонсо V. Этот союз, заключённый 3 июля в Неаполе, ещё больше укрепляет силу и мощь Феррары.
Жена: Элеонора Арагонская (22 июня 1450 — 11 октября 1493) — дочь Фернандо I, короля Неаполитанского и Изабеллы де Клермон, принцессы ди Таранто.
Дети: