Йерун Верхувен родился 30 апреля 1980 года в городе Нарден. В 1985 году, Верхувен в возрасте 5 лет начал заниматься футболом в детской команде БФК из города Бюссума. Но сначала будущий вратарь играл в команде на позиции нападающего, а за забитый гол, дедушка Верхувена давал ему 1 гюльден.
После того как Йерун перешёл в из возрастной группы БФК D3 в C1, он стал играть на позиции голкипера. После одного года выступлений за БФК C1, Йерун был переведён в БФК B1. Отыграв полгода за БФК B1, Верхувен получил письмо от скаута амстердамского «Аякса». В возрасте 14 лет Йерун отправился на просмотр в юношескую команду «Аякса», где тренером вратарей являлся Франс Хук. После нескольких тренировок, Йеруна в 1994 году взяли в «Аякс».
За несколько лет Верхувен поиграл за различные возрастные команды «Аякса»: B2, B1, A2 и A1. За четыре года в «Аяксе» у Йеруна сменилось несколько тренеров, среди которых был Франс Кук, Хейни Отто, Дик де Грот, Херман Борман и Ян Ольде Рикеринк. Но после того, как клуб не стал предлагать 18-летнему Верхувену контракт, то Йерун был вынужден покинуть клуб и перейти в 1998 году в «Валвейк».
(откорректировано по состоянию на 20 марта 2011 года)