Евгений Чернов родился в Новосибирске. Тренировался в ДЮСШ «Сибирь». После этого выступал за основную команду «Сибирь» (Новосибирск), а также за «Металлург» (Ачинск)
В 1999—2006 годах выступал за хоккейный клуб «Мотор» (Барнаул), где провел 337 игры, забил 51 шайбу и сделал 58 голевых передач. После расформирования команды Евгений Чернов перешёл в клуб «Алтай» (Барнаул), где стал капитаном.
В апреле 2010 года назначен исполняющим обязанности главного тренера ХК «Алтай».